¿Cómo genotipamos tu muestra? Así es un Global Screening Array - ADNTRO

¿Cómo genotipamos tu muestra? Así es un Global Screening Array

En ADNTRO, el primer paso para comenzar tu viaje a través de tu ADN es tomarte una muestra de saliva. La muestra la mandamos analizar a Eurofins Lab, en Dinamarca, uno de los mayores centros de genotipado en europa. El laboratorio analiza la muestra mediante la técnica Global Screening Array, y nos ofrece los datos que procesamos en ADNTRO para poder ofrecerte todo el contenido que verás en la demo de nuestra web.

¿cómo analiza el laboratorio la muestra de saliva?

En la muestra se encuentran células de la pared de la boca que fueron arrastradas por la saliva. Estas células contienen el ADN que se analizará mediante la técnica de Global Screening Array.

En primer lugar se extrae el ADN mediante un procedimiento que rompe las membranas de las células y separa los componentes internos, quedándose únicamente con el ADN purificado. Este ADN se clonará miles de veces utilizando la técnica PCR y sustituyendo los nucelótidos naturales por unos marcados con fluorescencia.

Después el ADN será fragmentado en pequeños trozos o regiones. Estas regiones incluyen genes concretos que nos permitirán averiguar, en función de qué SNPs (variantes de un nucleótido) tengan, posibles características fenotípicas como el color de los ojos, una intolerancia alimentaria o un origen étnico concreto.

Si aún no sabe qué es un SNP le invitamos a que lea nuestro artículo en el que lo explicamos pinchando aquí.

¿Qué es un chip de ADN en un Global Screening Array?

Por otro lado, se fabrica una superficie sólida de unos 2 x 2 cm llamada chip de ADN. El chip contiene 700.000 posiciones o pocillos en los que se fija una sonda de ADN para cada SNP concreto. Esto es una secuencia de ADN que se corresponde con la parte de un gen en el que se encuentra un SNP concreto. Sobre este chip se vierte, con la ayuda de dispositivos automáticos capaces de depositar gotas muy pequeñas en posiciones definidas, nuestra muestra de ADN clonado y fragmentado y se deja incubar durante el tiempo suficiente para que el ADN pueda hibridar.

Si la muestra contiene la variante de SNP que concuerda con la sonda del chip, las hebras de ADN hibridarán. De esta forma queda el fragmento de ADN muestra unido a la sonda. Como la sonda se encuentra fija a la placa, podremos lavar el chip y el fragmento muestra no se retirará, a no ser que no contuviera la variante de SNP de la sonda, en cuyo caso será eliminado con el lavado al no haber hibridado.

Tras la incubación y el lavado, se analiza el chip con una máquina capaz de reconocer fluorescencia en todas las posiciones. Aquellas que contengan el fragmento de ADN muestra hibridado serán las que tengan fluorescencia mientras que en las que no haya hibridado, el fragmento se habrá retirado y con él la fluorescencia.

Con esto termina el Global Screening Array, obteniendo todos los datos en bruto que Eurofins nos enviará para que analicemos en ADNTRO. Lo único que queda es que explore su propio ADN en su espacio personal de ADNTRO.

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